Quando você tiver uma gemlist com diferentes versões de uma gem e quiser utilizar uma versão específica para determinada aplicação em um comando qualquer, use a seguinte sintaxe:
nomeDaGem _Versao_ parametros
No exemplo abaixo, executo um comando no redmine que solicitou uma versão específica:
rake _10.0.3_ redmine:plugins:migrate RAILS_ENV=production
Caso não esteja utilizando a versão correta, pode receber um erro do tipo
You have already activated rake 10.0.4, but your Gemfile requires rake 10.0.3. Using bundle exec may solve this.
Enjoy